Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW34

TMEM239, Transmembrane protein 239, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM239Q8WW34 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM239Q8WW34 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM239Q8WW34 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM239Q8WW34 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM239Q8WW34 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM239Q8WW34 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM239Q8WW34 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM239Q8WW34 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM239Q8WW34 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM239Q8WW34 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM239Q8WW34 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM239Q8WW34 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM239Q8WW34 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM239Q8WW34 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM239Q8WW34 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM239Q8WW34 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM239Q8WW34 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM239Q8WW34 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM239Q8WW34 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM239Q8WW34 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM239Q8WW34 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM239Q8WW34 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms