Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACBD4Q8NC06 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACBD4Q8NC06 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms