Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEST3Q8N1M1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BEST3Q8N1M1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEST3Q8N1M1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEST3Q8N1M1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BEST3Q8N1M1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEST3Q8N1M1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEST3Q8N1M1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEST3Q8N1M1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEST3Q8N1M1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEST3Q8N1M1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEST3Q8N1M1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEST3Q8N1M1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEST3Q8N1M1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEST3Q8N1M1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEST3Q8N1M1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BEST3Q8N1M1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEST3Q8N1M1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST3Q8N1M1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST3Q8N1M1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST3Q8N1M1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST3Q8N1M1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms