Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM48Q8IWZ4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM48Q8IWZ4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM48Q8IWZ4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM48Q8IWZ4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM48Q8IWZ4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM48Q8IWZ4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms