Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC50Q8IVM0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC50Q8IVM0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms