Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
USP31Q70CQ4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
USP31Q70CQ4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
USP31Q70CQ4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34■■■■□ 3.03
USP31Q70CQ4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
USP31Q70CQ4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
USP31Q70CQ4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
USP31Q70CQ4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
USP31Q70CQ4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP31Q70CQ4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP31Q70CQ4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP31Q70CQ4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP31Q70CQ4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
USP31Q70CQ4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP31Q70CQ4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP31Q70CQ4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP31Q70CQ4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
USP31Q70CQ4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
USP31Q70CQ4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
USP31Q70CQ4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
USP31Q70CQ4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
USP31Q70CQ4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP31Q70CQ4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
USP31Q70CQ4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
USP31Q70CQ4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
USP31Q70CQ4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
USP31Q70CQ4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
USP31Q70CQ4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
USP31Q70CQ4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
USP31Q70CQ4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP31Q70CQ4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP31Q70CQ4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP31Q70CQ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP31Q70CQ4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP31Q70CQ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP31Q70CQ4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP31Q70CQ4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP31Q70CQ4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP31Q70CQ4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP31Q70CQ4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP31Q70CQ4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP31Q70CQ4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP31Q70CQ4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.82■■■■□ 3
USP31Q70CQ4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
USP31Q70CQ4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
USP31Q70CQ4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
USP31Q70CQ4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.81■■■■□ 3
USP31Q70CQ4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
USP31Q70CQ4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.81■■■■□ 3
USP31Q70CQ4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
USP31Q70CQ4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
USP31Q70CQ4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
USP31Q70CQ4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.8■■■■□ 3
USP31Q70CQ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms