Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.3 ms