Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TXNDC8Q6A555 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
TXNDC8Q6A555 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TXNDC8Q6A555 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms