Protein–RNA interactions for Protein: Q66PJ3

ARL6IP4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL6IP4Q66PJ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ARL6IP4Q66PJ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARL6IP4Q66PJ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARL6IP4Q66PJ3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ARL6IP4Q66PJ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARL6IP4Q66PJ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARL6IP4Q66PJ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARL6IP4Q66PJ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARL6IP4Q66PJ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARL6IP4Q66PJ3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARL6IP4Q66PJ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARL6IP4Q66PJ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARL6IP4Q66PJ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARL6IP4Q66PJ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARL6IP4Q66PJ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARL6IP4Q66PJ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARL6IP4Q66PJ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARL6IP4Q66PJ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARL6IP4Q66PJ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARL6IP4Q66PJ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARL6IP4Q66PJ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ARL6IP4Q66PJ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARL6IP4Q66PJ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARL6IP4Q66PJ3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARL6IP4Q66PJ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARL6IP4Q66PJ3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARL6IP4Q66PJ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARL6IP4Q66PJ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARL6IP4Q66PJ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARL6IP4Q66PJ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARL6IP4Q66PJ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARL6IP4Q66PJ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARL6IP4Q66PJ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARL6IP4Q66PJ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARL6IP4Q66PJ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARL6IP4Q66PJ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ARL6IP4Q66PJ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ARL6IP4Q66PJ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARL6IP4Q66PJ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARL6IP4Q66PJ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms