Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF20Q5VTR2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF20Q5VTR2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF20Q5VTR2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF20Q5VTR2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF20Q5VTR2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF20Q5VTR2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF20Q5VTR2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF20Q5VTR2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF20Q5VTR2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF20Q5VTR2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF20Q5VTR2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF20Q5VTR2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF20Q5VTR2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF20Q5VTR2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
RNF20Q5VTR2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF20Q5VTR2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF20Q5VTR2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF20Q5VTR2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF20Q5VTR2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF20Q5VTR2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF20Q5VTR2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF20Q5VTR2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms