Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC7Q5VTL7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNDC7Q5VTL7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms