Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8M3

EMC4, ER membrane protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC4Q5J8M3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMC4Q5J8M3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMC4Q5J8M3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms