Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF542PQ5EBM4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF542PQ5EBM4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.7 ms