Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EDRF1Q3B7T1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDRF1Q3B7T1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms