Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECM1Q16610 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECM1Q16610 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECM1Q16610 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ECM1Q16610 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ECM1Q16610 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECM1Q16610 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms