Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB35Q15286 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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RAB35Q15286 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB35Q15286 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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