Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms