Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HSPB3Q12988 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPB3Q12988 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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