Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TP53BP1Q12888 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TP53BP1Q12888 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TP53BP1Q12888 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms