Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM27E3Q08E93 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM27E3Q08E93 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM27E3Q08E93 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms