Protein–RNA interactions for Protein: Q05066

SRY, Sex-determining region Y protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRYQ05066 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRYQ05066 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SRYQ05066 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRYQ05066 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRYQ05066 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SRYQ05066 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRYQ05066 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRYQ05066 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRYQ05066 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRYQ05066 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRYQ05066 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRYQ05066 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRYQ05066 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SRYQ05066 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRYQ05066 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRYQ05066 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRYQ05066 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRYQ05066 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRYQ05066 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRYQ05066 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRYQ05066 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRYQ05066 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRYQ05066 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRYQ05066 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRYQ05066 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRYQ05066 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRYQ05066 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRYQ05066 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRYQ05066 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRYQ05066 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRYQ05066 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRYQ05066 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRYQ05066 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRYQ05066 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRYQ05066 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SRYQ05066 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRYQ05066 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRYQ05066 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRYQ05066 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRYQ05066 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRYQ05066 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRYQ05066 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRYQ05066 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRYQ05066 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRYQ05066 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRYQ05066 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRYQ05066 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRYQ05066 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRYQ05066 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SRYQ05066 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRYQ05066 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRYQ05066 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRYQ05066 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRYQ05066 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRYQ05066 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRYQ05066 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRYQ05066 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRYQ05066 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRYQ05066 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRYQ05066 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRYQ05066 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRYQ05066 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRYQ05066 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRYQ05066 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRYQ05066 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRYQ05066 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRYQ05066 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRYQ05066 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRYQ05066 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRYQ05066 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRYQ05066 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRYQ05066 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRYQ05066 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRYQ05066 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRYQ05066 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRYQ05066 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRYQ05066 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRYQ05066 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRYQ05066 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRYQ05066 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRYQ05066 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRYQ05066 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRYQ05066 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRYQ05066 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRYQ05066 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRYQ05066 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRYQ05066 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SRYQ05066 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRYQ05066 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRYQ05066 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRYQ05066 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRYQ05066 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRYQ05066 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRYQ05066 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRYQ05066 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SRYQ05066 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRYQ05066 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRYQ05066 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRYQ05066 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRYQ05066 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms