Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM3AP98173 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3AP98173 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
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