Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAE1P78406 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAE1P78406 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAE1P78406 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAE1P78406 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAE1P78406 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAE1P78406 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAE1P78406 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAE1P78406 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAE1P78406 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RAE1P78406 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAE1P78406 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAE1P78406 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAE1P78406 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAE1P78406 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RAE1P78406 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RAE1P78406 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RAE1P78406 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RAE1P78406 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAE1P78406 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAE1P78406 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAE1P78406 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAE1P78406 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAE1P78406 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAE1P78406 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAE1P78406 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAE1P78406 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAE1P78406 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAE1P78406 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAE1P78406 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAE1P78406 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAE1P78406 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAE1P78406 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAE1P78406 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAE1P78406 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAE1P78406 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAE1P78406 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAE1P78406 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAE1P78406 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAE1P78406 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAE1P78406 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAE1P78406 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAE1P78406 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAE1P78406 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAE1P78406 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAE1P78406 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAE1P78406 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAE1P78406 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAE1P78406 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAE1P78406 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAE1P78406 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAE1P78406 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAE1P78406 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAE1P78406 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAE1P78406 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAE1P78406 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAE1P78406 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAE1P78406 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAE1P78406 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAE1P78406 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAE1P78406 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAE1P78406 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAE1P78406 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAE1P78406 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAE1P78406 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAE1P78406 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAE1P78406 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAE1P78406 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAE1P78406 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAE1P78406 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAE1P78406 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAE1P78406 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAE1P78406 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAE1P78406 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAE1P78406 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAE1P78406 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAE1P78406 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAE1P78406 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAE1P78406 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAE1P78406 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAE1P78406 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAE1P78406 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAE1P78406 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAE1P78406 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAE1P78406 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAE1P78406 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAE1P78406 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAE1P78406 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAE1P78406 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RAE1P78406 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAE1P78406 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAE1P78406 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAE1P78406 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAE1P78406 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAE1P78406 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAE1P78406 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAE1P78406 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAE1P78406 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAE1P78406 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAE1P78406 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms