Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMP3P54852 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMP3P54852 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMP3P54852 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMP3P54852 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMP3P54852 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMP3P54852 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMP3P54852 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMP3P54852 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMP3P54852 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMP3P54852 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMP3P54852 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMP3P54852 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMP3P54852 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMP3P54852 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMP3P54852 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMP3P54852 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMP3P54852 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMP3P54852 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EMP3P54852 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMP3P54852 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMP3P54852 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMP3P54852 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMP3P54852 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMP3P54852 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMP3P54852 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMP3P54852 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMP3P54852 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMP3P54852 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMP3P54852 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMP3P54852 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMP3P54852 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMP3P54852 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMP3P54852 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMP3P54852 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMP3P54852 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMP3P54852 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMP3P54852 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMP3P54852 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
EMP3P54852 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMP3P54852 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMP3P54852 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMP3P54852 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMP3P54852 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMP3P54852 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMP3P54852 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMP3P54852 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMP3P54852 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EMP3P54852 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMP3P54852 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMP3P54852 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMP3P54852 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMP3P54852 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMP3P54852 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMP3P54852 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMP3P54852 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMP3P54852 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMP3P54852 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMP3P54852 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EMP3P54852 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EMP3P54852 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EMP3P54852 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EMP3P54852 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMP3P54852 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMP3P54852 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMP3P54852 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMP3P54852 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMP3P54852 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
EMP3P54852 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMP3P54852 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMP3P54852 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMP3P54852 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMP3P54852 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMP3P54852 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMP3P54852 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMP3P54852 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMP3P54852 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMP3P54852 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMP3P54852 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMP3P54852 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMP3P54852 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMP3P54852 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMP3P54852 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMP3P54852 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMP3P54852 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMP3P54852 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMP3P54852 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMP3P54852 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMP3P54852 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMP3P54852 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMP3P54852 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EMP3P54852 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMP3P54852 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMP3P54852 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMP3P54852 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMP3P54852 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMP3P54852 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMP3P54852 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMP3P54852 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMP3P54852 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms