Protein–RNA interactions for Protein: P51825

AFF1, AF4/FMR2 family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF1P51825 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
AFF1P51825 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFF1P51825 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFF1P51825 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFF1P51825 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AFF1P51825 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AFF1P51825 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AFF1P51825 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFF1P51825 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFF1P51825 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AFF1P51825 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
AFF1P51825 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AFF1P51825 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AFF1P51825 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AFF1P51825 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AFF1P51825 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
AFF1P51825 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AFF1P51825 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AFF1P51825 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
AFF1P51825 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFF1P51825 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFF1P51825 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFF1P51825 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFF1P51825 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFF1P51825 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFF1P51825 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFF1P51825 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFF1P51825 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFF1P51825 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFF1P51825 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFF1P51825 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFF1P51825 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFF1P51825 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFF1P51825 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFF1P51825 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AFF1P51825 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AFF1P51825 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AFF1P51825 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AFF1P51825 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AFF1P51825 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AFF1P51825 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AFF1P51825 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AFF1P51825 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
AFF1P51825 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AFF1P51825 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AFF1P51825 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AFF1P51825 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AFF1P51825 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
AFF1P51825 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AFF1P51825 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27■■□□□ 1.91
AFF1P51825 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AFF1P51825 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AFF1P51825 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AFF1P51825 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AFF1P51825 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AFF1P51825 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AFF1P51825 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
AFF1P51825 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AFF1P51825 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AFF1P51825 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AFF1P51825 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AFF1P51825 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AFF1P51825 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
AFF1P51825 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AFF1P51825 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AFF1P51825 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
AFF1P51825 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AFF1P51825 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
AFF1P51825 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AFF1P51825 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AFF1P51825 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AFF1P51825 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AFF1P51825 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AFF1P51825 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
AFF1P51825 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
AFF1P51825 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
AFF1P51825 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AFF1P51825 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AFF1P51825 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AFF1P51825 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AFF1P51825 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AFF1P51825 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AFF1P51825 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AFF1P51825 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
AFF1P51825 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AFF1P51825 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AFF1P51825 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AFF1P51825 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
AFF1P51825 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AFF1P51825 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AFF1P51825 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AFF1P51825 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AFF1P51825 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AFF1P51825 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
AFF1P51825 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
AFF1P51825 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
AFF1P51825 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
AFF1P51825 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
AFF1P51825 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
AFF1P51825 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms