Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTPAP49638 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTPAP49638 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTPAP49638 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTPAP49638 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTPAP49638 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTPAP49638 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTPAP49638 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTPAP49638 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTPAP49638 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTPAP49638 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTPAP49638 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TTPAP49638 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TTPAP49638 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTPAP49638 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTPAP49638 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTPAP49638 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTPAP49638 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTPAP49638 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTPAP49638 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTPAP49638 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTPAP49638 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTPAP49638 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTPAP49638 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTPAP49638 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTPAP49638 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTPAP49638 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTPAP49638 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTPAP49638 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TTPAP49638 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TTPAP49638 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTPAP49638 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTPAP49638 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTPAP49638 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTPAP49638 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTPAP49638 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTPAP49638 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTPAP49638 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTPAP49638 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTPAP49638 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTPAP49638 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTPAP49638 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTPAP49638 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTPAP49638 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TTPAP49638 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTPAP49638 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TTPAP49638 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTPAP49638 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTPAP49638 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTPAP49638 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTPAP49638 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTPAP49638 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTPAP49638 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTPAP49638 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTPAP49638 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TTPAP49638 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTPAP49638 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTPAP49638 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TTPAP49638 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TTPAP49638 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTPAP49638 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTPAP49638 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTPAP49638 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTPAP49638 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTPAP49638 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTPAP49638 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTPAP49638 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTPAP49638 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTPAP49638 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTPAP49638 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTPAP49638 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTPAP49638 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTPAP49638 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTPAP49638 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTPAP49638 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTPAP49638 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTPAP49638 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTPAP49638 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTPAP49638 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTPAP49638 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTPAP49638 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTPAP49638 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTPAP49638 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTPAP49638 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTPAP49638 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTPAP49638 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTPAP49638 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTPAP49638 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTPAP49638 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTPAP49638 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTPAP49638 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTPAP49638 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTPAP49638 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTPAP49638 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTPAP49638 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTPAP49638 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTPAP49638 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTPAP49638 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTPAP49638 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTPAP49638 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
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