Protein–RNA interactions for Protein: P49006

MARCKSL1, MARCKS-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSL1P49006 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCKSL1P49006 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCKSL1P49006 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCKSL1P49006 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCKSL1P49006 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCKSL1P49006 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCKSL1P49006 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MARCKSL1P49006 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MARCKSL1P49006 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MARCKSL1P49006 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MARCKSL1P49006 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MARCKSL1P49006 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MARCKSL1P49006 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MARCKSL1P49006 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MARCKSL1P49006 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MARCKSL1P49006 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MARCKSL1P49006 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MARCKSL1P49006 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MARCKSL1P49006 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MARCKSL1P49006 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MARCKSL1P49006 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MARCKSL1P49006 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MARCKSL1P49006 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MARCKSL1P49006 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MARCKSL1P49006 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MARCKSL1P49006 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MARCKSL1P49006 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MARCKSL1P49006 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCKSL1P49006 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCKSL1P49006 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms