Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA9P31269 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA9P31269 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA9P31269 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms