Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD1CP29017 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD1CP29017 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD1CP29017 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD1CP29017 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD1CP29017 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD1CP29017 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD1CP29017 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD1CP29017 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD1CP29017 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CD1CP29017 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD1CP29017 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD1CP29017 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD1CP29017 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD1CP29017 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD1CP29017 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD1CP29017 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD1CP29017 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD1CP29017 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CD1CP29017 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CD1CP29017 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD1CP29017 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD1CP29017 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD1CP29017 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD1CP29017 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD1CP29017 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD1CP29017 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD1CP29017 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD1CP29017 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CD1CP29017 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD1CP29017 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD1CP29017 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD1CP29017 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD1CP29017 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD1CP29017 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD1CP29017 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD1CP29017 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD1CP29017 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD1CP29017 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD1CP29017 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD1CP29017 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CD1CP29017 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD1CP29017 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD1CP29017 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD1CP29017 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD1CP29017 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD1CP29017 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD1CP29017 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD1CP29017 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD1CP29017 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD1CP29017 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CD1CP29017 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CD1CP29017 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD1CP29017 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD1CP29017 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD1CP29017 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD1CP29017 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD1CP29017 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD1CP29017 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD1CP29017 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD1CP29017 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD1CP29017 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD1CP29017 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD1CP29017 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD1CP29017 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD1CP29017 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD1CP29017 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD1CP29017 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD1CP29017 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD1CP29017 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CD1CP29017 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD1CP29017 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CD1CP29017 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD1CP29017 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CD1CP29017 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD1CP29017 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD1CP29017 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CD1CP29017 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD1CP29017 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD1CP29017 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD1CP29017 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD1CP29017 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD1CP29017 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CD1CP29017 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD1CP29017 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD1CP29017 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD1CP29017 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD1CP29017 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD1CP29017 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD1CP29017 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD1CP29017 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD1CP29017 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CD1CP29017 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CD1CP29017 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD1CP29017 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD1CP29017 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD1CP29017 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD1CP29017 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CD1CP29017 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD1CP29017 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms