Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF4P23510 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF4P23510 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF4P23510 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF4P23510 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF4P23510 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF4P23510 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF4P23510 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
TNFSF4P23510 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNFSF4P23510 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF4P23510 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms