Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFE3P19532 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFE3P19532 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TFE3P19532 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFE3P19532 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFE3P19532 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFE3P19532 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFE3P19532 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFE3P19532 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFE3P19532 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFE3P19532 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFE3P19532 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFE3P19532 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFE3P19532 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFE3P19532 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFE3P19532 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFE3P19532 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFE3P19532 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFE3P19532 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFE3P19532 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFE3P19532 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFE3P19532 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFE3P19532 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFE3P19532 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFE3P19532 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFE3P19532 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFE3P19532 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFE3P19532 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFE3P19532 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFE3P19532 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFE3P19532 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFE3P19532 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TFE3P19532 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFE3P19532 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFE3P19532 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFE3P19532 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFE3P19532 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFE3P19532 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFE3P19532 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFE3P19532 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFE3P19532 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFE3P19532 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFE3P19532 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFE3P19532 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFE3P19532 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFE3P19532 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TFE3P19532 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFE3P19532 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFE3P19532 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TFE3P19532 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFE3P19532 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFE3P19532 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFE3P19532 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFE3P19532 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFE3P19532 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFE3P19532 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFE3P19532 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFE3P19532 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFE3P19532 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFE3P19532 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFE3P19532 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFE3P19532 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFE3P19532 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TFE3P19532 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TFE3P19532 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TFE3P19532 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TFE3P19532 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFE3P19532 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFE3P19532 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFE3P19532 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TFE3P19532 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFE3P19532 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFE3P19532 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFE3P19532 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFE3P19532 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFE3P19532 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFE3P19532 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFE3P19532 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFE3P19532 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFE3P19532 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFE3P19532 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFE3P19532 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFE3P19532 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFE3P19532 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFE3P19532 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFE3P19532 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFE3P19532 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFE3P19532 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFE3P19532 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFE3P19532 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFE3P19532 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFE3P19532 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFE3P19532 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFE3P19532 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TFE3P19532 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFE3P19532 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFE3P19532 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFE3P19532 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFE3P19532 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFE3P19532 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1835.7 ms