Protein–RNA interactions for Protein: P17035

ZNF28, Zinc finger protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28P17035 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF28P17035 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms