Protein–RNA interactions for Protein: P0C263

SBK2, Serine/threonine-protein kinase SBK2, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK2P0C263 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SBK2P0C263 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SBK2P0C263 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBK2P0C263 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SBK2P0C263 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SBK2P0C263 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK2P0C263 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK2P0C263 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK2P0C263 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK2P0C263 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms