Protein–RNA interactions for Protein: P08603

CFH, Complement factor H, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHP08603 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFHP08603 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CFHP08603 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CFHP08603 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFHP08603 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFHP08603 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFHP08603 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFHP08603 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFHP08603 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFHP08603 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFHP08603 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFHP08603 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFHP08603 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFHP08603 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CFHP08603 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFHP08603 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFHP08603 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CFHP08603 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFHP08603 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFHP08603 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFHP08603 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFHP08603 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFHP08603 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFHP08603 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFHP08603 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFHP08603 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFHP08603 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFHP08603 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFHP08603 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFHP08603 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFHP08603 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFHP08603 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFHP08603 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFHP08603 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFHP08603 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFHP08603 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFHP08603 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFHP08603 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFHP08603 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFHP08603 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFHP08603 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFHP08603 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFHP08603 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFHP08603 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CFHP08603 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFHP08603 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFHP08603 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFHP08603 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFHP08603 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFHP08603 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFHP08603 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFHP08603 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFHP08603 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFHP08603 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFHP08603 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFHP08603 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CFHP08603 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFHP08603 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFHP08603 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFHP08603 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFHP08603 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFHP08603 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CFHP08603 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFHP08603 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFHP08603 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFHP08603 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFHP08603 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFHP08603 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFHP08603 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFHP08603 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFHP08603 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFHP08603 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFHP08603 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFHP08603 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFHP08603 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFHP08603 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFHP08603 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFHP08603 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFHP08603 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFHP08603 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFHP08603 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFHP08603 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFHP08603 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFHP08603 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFHP08603 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFHP08603 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFHP08603 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFHP08603 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFHP08603 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFHP08603 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFHP08603 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFHP08603 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFHP08603 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFHP08603 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CFHP08603 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFHP08603 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFHP08603 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFHP08603 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFHP08603 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFHP08603 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms