Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOA4P06727 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOA4P06727 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOA4P06727 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOA4P06727 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOA4P06727 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOA4P06727 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOA4P06727 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOA4P06727 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOA4P06727 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOA4P06727 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOA4P06727 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOA4P06727 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA4P06727 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA4P06727 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA4P06727 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA4P06727 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA4P06727 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA4P06727 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA4P06727 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA4P06727 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA4P06727 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA4P06727 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOA4P06727 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOA4P06727 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOA4P06727 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOA4P06727 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOA4P06727 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOA4P06727 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA4P06727 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA4P06727 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA4P06727 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA4P06727 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA4P06727 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA4P06727 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA4P06727 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOA4P06727 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOA4P06727 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOA4P06727 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOA4P06727 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOA4P06727 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOA4P06727 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOA4P06727 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOA4P06727 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOA4P06727 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOA4P06727 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOA4P06727 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOA4P06727 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOA4P06727 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOA4P06727 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOA4P06727 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOA4P06727 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOA4P06727 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOA4P06727 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
APOA4P06727 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
APOA4P06727 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOA4P06727 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOA4P06727 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOA4P06727 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOA4P06727 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOA4P06727 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOA4P06727 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOA4P06727 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOA4P06727 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOA4P06727 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOA4P06727 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOA4P06727 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOA4P06727 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOA4P06727 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOA4P06727 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOA4P06727 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA4P06727 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA4P06727 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA4P06727 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA4P06727 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA4P06727 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA4P06727 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA4P06727 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA4P06727 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA4P06727 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOA4P06727 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOA4P06727 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOA4P06727 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOA4P06727 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOA4P06727 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOA4P06727 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA4P06727 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA4P06727 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA4P06727 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOA4P06727 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOA4P06727 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOA4P06727 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
APOA4P06727 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
APOA4P06727 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOA4P06727 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOA4P06727 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
APOA4P06727 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOA4P06727 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
APOA4P06727 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA4P06727 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms