Protein–RNA interactions for Protein: P04637

TP53, Cellular tumor antigen p53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53P04637 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TP53P04637 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TP53P04637 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TP53P04637 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TP53P04637 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TP53P04637 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TP53P04637 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TP53P04637 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TP53P04637 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TP53P04637 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TP53P04637 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TP53P04637 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TP53P04637 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TP53P04637 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TP53P04637 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TP53P04637 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TP53P04637 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TP53P04637 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TP53P04637 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TP53P04637 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TP53P04637 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP53P04637 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP53P04637 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP53P04637 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP53P04637 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP53P04637 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP53P04637 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP53P04637 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP53P04637 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP53P04637 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP53P04637 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP53P04637 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP53P04637 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP53P04637 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP53P04637 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP53P04637 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP53P04637 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP53P04637 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP53P04637 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP53P04637 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TP53P04637 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP53P04637 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TP53P04637 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP53P04637 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP53P04637 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP53P04637 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP53P04637 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP53P04637 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TP53P04637 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TP53P04637 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TP53P04637 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TP53P04637 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TP53P04637 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TP53P04637 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TP53P04637 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TP53P04637 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP53P04637 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP53P04637 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP53P04637 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP53P04637 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP53P04637 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TP53P04637 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP53P04637 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP53P04637 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP53P04637 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP53P04637 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP53P04637 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP53P04637 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP53P04637 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP53P04637 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP53P04637 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP53P04637 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP53P04637 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP53P04637 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP53P04637 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TP53P04637 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP53P04637 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP53P04637 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TP53P04637 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TP53P04637 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TP53P04637 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TP53P04637 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TP53P04637 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TP53P04637 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TP53P04637 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TP53P04637 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TP53P04637 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TP53P04637 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TP53P04637 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TP53P04637 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TP53P04637 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TP53P04637 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TP53P04637 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TP53P04637 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP53P04637 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP53P04637 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP53P04637 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP53P04637 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP53P04637 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP53P04637 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms