Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ESR1P03372 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ESR1P03372 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ESR1P03372 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ESR1P03372 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ESR1P03372 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ESR1P03372 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ESR1P03372 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ESR1P03372 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ESR1P03372 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ESR1P03372 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ESR1P03372 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ESR1P03372 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ESR1P03372 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ESR1P03372 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ESR1P03372 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ESR1P03372 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ESR1P03372 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ESR1P03372 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ESR1P03372 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ESR1P03372 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ESR1P03372 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ESR1P03372 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ESR1P03372 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ESR1P03372 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ESR1P03372 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ESR1P03372 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ESR1P03372 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ESR1P03372 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ESR1P03372 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ESR1P03372 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ESR1P03372 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ESR1P03372 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ESR1P03372 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ESR1P03372 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ESR1P03372 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ESR1P03372 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ESR1P03372 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ESR1P03372 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ESR1P03372 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ESR1P03372 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ESR1P03372 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ESR1P03372 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ESR1P03372 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ESR1P03372 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ESR1P03372 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ESR1P03372 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ESR1P03372 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ESR1P03372 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ESR1P03372 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ESR1P03372 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ESR1P03372 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ESR1P03372 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ESR1P03372 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ESR1P03372 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ESR1P03372 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ESR1P03372 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ESR1P03372 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ESR1P03372 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ESR1P03372 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ESR1P03372 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ESR1P03372 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ESR1P03372 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ESR1P03372 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ESR1P03372 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ESR1P03372 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ESR1P03372 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ESR1P03372 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ESR1P03372 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ESR1P03372 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ESR1P03372 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ESR1P03372 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ESR1P03372 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ESR1P03372 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ESR1P03372 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ESR1P03372 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ESR1P03372 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ESR1P03372 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ESR1P03372 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ESR1P03372 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ESR1P03372 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ESR1P03372 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ESR1P03372 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ESR1P03372 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ESR1P03372 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ESR1P03372 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ESR1P03372 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ESR1P03372 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ESR1P03372 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ESR1P03372 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ESR1P03372 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ESR1P03372 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ESR1P03372 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ESR1P03372 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ESR1P03372 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ESR1P03372 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ESR1P03372 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ESR1P03372 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ESR1P03372 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ESR1P03372 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms