Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOEP02649 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOEP02649 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOEP02649 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOEP02649 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOEP02649 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOEP02649 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
APOEP02649 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOEP02649 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOEP02649 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOEP02649 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOEP02649 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOEP02649 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOEP02649 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOEP02649 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOEP02649 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOEP02649 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOEP02649 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOEP02649 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOEP02649 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOEP02649 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
APOEP02649 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOEP02649 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOEP02649 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOEP02649 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOEP02649 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOEP02649 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOEP02649 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOEP02649 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOEP02649 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOEP02649 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOEP02649 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOEP02649 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOEP02649 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOEP02649 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOEP02649 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOEP02649 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOEP02649 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOEP02649 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOEP02649 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOEP02649 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOEP02649 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
APOEP02649 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
APOEP02649 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOEP02649 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOEP02649 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOEP02649 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOEP02649 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOEP02649 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOEP02649 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOEP02649 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOEP02649 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOEP02649 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOEP02649 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOEP02649 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOEP02649 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOEP02649 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOEP02649 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOEP02649 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
APOEP02649 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOEP02649 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOEP02649 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOEP02649 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOEP02649 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOEP02649 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOEP02649 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
APOEP02649 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
APOEP02649 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
APOEP02649 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
APOEP02649 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOEP02649 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOEP02649 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOEP02649 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
APOEP02649 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOEP02649 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOEP02649 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOEP02649 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOEP02649 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOEP02649 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOEP02649 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOEP02649 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOEP02649 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOEP02649 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOEP02649 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOEP02649 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOEP02649 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOEP02649 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOEP02649 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOEP02649 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOEP02649 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
APOEP02649 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
APOEP02649 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOEP02649 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOEP02649 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOEP02649 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOEP02649 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOEP02649 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
APOEP02649 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOEP02649 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOEP02649 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms