Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PEX11BO96011 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX11BO96011 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.1 ms