Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDKL5O76039 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDKL5O76039 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDKL5O76039 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms