Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPFIA3O75145 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPFIA3O75145 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPFIA3O75145 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PPFIA3O75145 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPFIA3O75145 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PPFIA3O75145 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPFIA3O75145 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPFIA3O75145 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPFIA3O75145 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPFIA3O75145 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPFIA3O75145 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPFIA3O75145 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPFIA3O75145 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPFIA3O75145 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPFIA3O75145 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPFIA3O75145 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPFIA3O75145 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPFIA3O75145 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PPFIA3O75145 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPFIA3O75145 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms