Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF4O60810 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF4O60810 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF4O60810 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms