Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA3O43365 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA3O43365 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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