Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2A1O14983 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2A1O14983 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2A1O14983 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2A1O14983 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2A1O14983 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2A1O14983 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2A1O14983 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2A1O14983 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2A1O14983 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP2A1O14983 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP2A1O14983 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP2A1O14983 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2A1O14983 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2A1O14983 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2A1O14983 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2A1O14983 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2A1O14983 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2A1O14983 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2A1O14983 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2A1O14983 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2A1O14983 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP2A1O14983 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP2A1O14983 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms