Protein–RNA interactions for Protein: A6NJR5

Putative speedy protein-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NJR5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A6NJR5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
A6NJR5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A6NJR5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A6NJR5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A6NJR5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A6NJR5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
A6NJR5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A6NJR5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
A6NJR5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A6NJR5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A6NJR5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A6NJR5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A6NJR5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
A6NJR5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
A6NJR5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A6NJR5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
A6NJR5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A6NJR5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
A6NJR5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
A6NJR5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
A6NJR5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
A6NJR5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
A6NJR5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
A6NJR5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
A6NJR5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
A6NJR5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
A6NJR5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A6NJR5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A6NJR5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A6NJR5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
A6NJR5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
A6NJR5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
A6NJR5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
A6NJR5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
A6NJR5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
A6NJR5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
A6NJR5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
A6NJR5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A6NJR5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A6NJR5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
A6NJR5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
A6NJR5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A6NJR5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28■■■□□ 2.07
A6NJR5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
A6NJR5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
A6NJR5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
A6NJR5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
A6NJR5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
A6NJR5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A6NJR5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A6NJR5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A6NJR5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
A6NJR5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
A6NJR5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
A6NJR5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
A6NJR5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
A6NJR5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
A6NJR5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
A6NJR5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A6NJR5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
A6NJR5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
A6NJR5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
A6NJR5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A6NJR5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A6NJR5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
A6NJR5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
A6NJR5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
A6NJR5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A6NJR5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A6NJR5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A6NJR5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A6NJR5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
A6NJR5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
A6NJR5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
A6NJR5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
A6NJR5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
A6NJR5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
A6NJR5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
A6NJR5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
A6NJR5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
A6NJR5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
A6NJR5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
A6NJR5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
A6NJR5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
A6NJR5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
A6NJR5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
A6NJR5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
A6NJR5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A6NJR5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
A6NJR5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A6NJR5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
A6NJR5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A6NJR5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A6NJR5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
A6NJR5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
A6NJR5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
A6NJR5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A6NJR5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A6NJR5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms