Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
VWA3AA6NCI4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VWA3AA6NCI4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
VWA3AA6NCI4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VWA3AA6NCI4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VWA3AA6NCI4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VWA3AA6NCI4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VWA3AA6NCI4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VWA3AA6NCI4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VWA3AA6NCI4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VWA3AA6NCI4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VWA3AA6NCI4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VWA3AA6NCI4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
VWA3AA6NCI4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VWA3AA6NCI4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
VWA3AA6NCI4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VWA3AA6NCI4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VWA3AA6NCI4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VWA3AA6NCI4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VWA3AA6NCI4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
VWA3AA6NCI4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VWA3AA6NCI4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VWA3AA6NCI4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms