Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX10Q9Y5X0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX10Q9Y5X0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX10Q9Y5X0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX10Q9Y5X0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX10Q9Y5X0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX10Q9Y5X0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX10Q9Y5X0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX10Q9Y5X0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX10Q9Y5X0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX10Q9Y5X0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX10Q9Y5X0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX10Q9Y5X0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX10Q9Y5X0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX10Q9Y5X0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX10Q9Y5X0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX10Q9Y5X0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX10Q9Y5X0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX10Q9Y5X0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX10Q9Y5X0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX10Q9Y5X0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX10Q9Y5X0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX10Q9Y5X0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX10Q9Y5X0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX10Q9Y5X0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX10Q9Y5X0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SNX10Q9Y5X0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNX10Q9Y5X0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms