Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4U1

MMACHC, Methylmalonic aciduria and homocystinuria type C protein, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMACHCQ9Y4U1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMACHCQ9Y4U1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMACHCQ9Y4U1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMACHCQ9Y4U1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMACHCQ9Y4U1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMACHCQ9Y4U1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MMACHCQ9Y4U1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MMACHCQ9Y4U1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MMACHCQ9Y4U1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MMACHCQ9Y4U1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MMACHCQ9Y4U1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMACHCQ9Y4U1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMACHCQ9Y4U1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMACHCQ9Y4U1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms