Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A6Q9Y2P4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A6Q9Y2P4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A6Q9Y2P4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A6Q9Y2P4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A6Q9Y2P4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A6Q9Y2P4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A6Q9Y2P4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A6Q9Y2P4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A6Q9Y2P4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A6Q9Y2P4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A6Q9Y2P4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A6Q9Y2P4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A6Q9Y2P4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A6Q9Y2P4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A6Q9Y2P4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A6Q9Y2P4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A6Q9Y2P4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A6Q9Y2P4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A6Q9Y2P4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A6Q9Y2P4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A6Q9Y2P4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A6Q9Y2P4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A6Q9Y2P4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A6Q9Y2P4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A6Q9Y2P4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A6Q9Y2P4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A6Q9Y2P4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A6Q9Y2P4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A6Q9Y2P4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A6Q9Y2P4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A6Q9Y2P4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC27A6Q9Y2P4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A6Q9Y2P4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.6 ms