Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUDCQ9Y266 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUDCQ9Y266 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUDCQ9Y266 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUDCQ9Y266 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUDCQ9Y266 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUDCQ9Y266 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUDCQ9Y266 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUDCQ9Y266 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NUDCQ9Y266 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
NUDCQ9Y266 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUDCQ9Y266 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUDCQ9Y266 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUDCQ9Y266 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUDCQ9Y266 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NUDCQ9Y266 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NUDCQ9Y266 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NUDCQ9Y266 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUDCQ9Y266 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUDCQ9Y266 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUDCQ9Y266 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUDCQ9Y266 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUDCQ9Y266 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUDCQ9Y266 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUDCQ9Y266 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUDCQ9Y266 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NUDCQ9Y266 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NUDCQ9Y266 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NUDCQ9Y266 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NUDCQ9Y266 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NUDCQ9Y266 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NUDCQ9Y266 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
NUDCQ9Y266 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NUDCQ9Y266 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
NUDCQ9Y266 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NUDCQ9Y266 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NUDCQ9Y266 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NUDCQ9Y266 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NUDCQ9Y266 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.81■■■■□ 3
NUDCQ9Y266 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
NUDCQ9Y266 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
NUDCQ9Y266 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NUDCQ9Y266 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
NUDCQ9Y266 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.78■■■■□ 3
NUDCQ9Y266 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NUDCQ9Y266 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NUDCQ9Y266 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NUDCQ9Y266 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NUDCQ9Y266 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NUDCQ9Y266 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NUDCQ9Y266 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NUDCQ9Y266 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms